Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM3

Clcf1, Cardiotrophin-like cytokine factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcf1Q9QZM3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clcf1Q9QZM3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.4 ms