Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tomm40Q9QYA2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tomm40Q9QYA2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tomm40Q9QYA2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tomm40Q9QYA2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tomm40Q9QYA2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tomm40Q9QYA2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tomm40Q9QYA2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tomm40Q9QYA2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tomm40Q9QYA2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tomm40Q9QYA2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tomm40Q9QYA2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tomm40Q9QYA2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tomm40Q9QYA2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tomm40Q9QYA2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tomm40Q9QYA2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tomm40Q9QYA2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tomm40Q9QYA2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tomm40Q9QYA2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tomm40Q9QYA2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tomm40Q9QYA2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tomm40Q9QYA2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tomm40Q9QYA2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tomm40Q9QYA2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tomm40Q9QYA2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tomm40Q9QYA2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tomm40Q9QYA2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tomm40Q9QYA2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tomm40Q9QYA2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tomm40Q9QYA2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tomm40Q9QYA2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tomm40Q9QYA2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tomm40Q9QYA2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tomm40Q9QYA2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tomm40Q9QYA2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tomm40Q9QYA2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tomm40Q9QYA2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tomm40Q9QYA2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tomm40Q9QYA2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tomm40Q9QYA2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tomm40Q9QYA2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tomm40Q9QYA2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tomm40Q9QYA2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tomm40Q9QYA2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tomm40Q9QYA2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tomm40Q9QYA2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tomm40Q9QYA2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tomm40Q9QYA2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tomm40Q9QYA2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tomm40Q9QYA2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tomm40Q9QYA2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tomm40Q9QYA2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tomm40Q9QYA2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tomm40Q9QYA2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tomm40Q9QYA2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tomm40Q9QYA2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tomm40Q9QYA2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tomm40Q9QYA2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Tomm40Q9QYA2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tomm40Q9QYA2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tomm40Q9QYA2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tomm40Q9QYA2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms