Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pdzd4Q9QY39 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pdzd4Q9QY39 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzd4Q9QY39 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzd4Q9QY39 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzd4Q9QY39 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzd4Q9QY39 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzd4Q9QY39 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzd4Q9QY39 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzd4Q9QY39 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzd4Q9QY39 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzd4Q9QY39 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzd4Q9QY39 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzd4Q9QY39 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzd4Q9QY39 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzd4Q9QY39 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzd4Q9QY39 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzd4Q9QY39 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzd4Q9QY39 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzd4Q9QY39 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzd4Q9QY39 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzd4Q9QY39 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzd4Q9QY39 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzd4Q9QY39 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzd4Q9QY39 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzd4Q9QY39 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzd4Q9QY39 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzd4Q9QY39 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzd4Q9QY39 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzd4Q9QY39 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzd4Q9QY39 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzd4Q9QY39 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms