Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Nr2e3Q9QXZ7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nr2e3Q9QXZ7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nr2e3Q9QXZ7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nr2e3Q9QXZ7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nr2e3Q9QXZ7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nr2e3Q9QXZ7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nr2e3Q9QXZ7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nr2e3Q9QXZ7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nr2e3Q9QXZ7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nr2e3Q9QXZ7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nr2e3Q9QXZ7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nr2e3Q9QXZ7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nr2e3Q9QXZ7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nr2e3Q9QXZ7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nr2e3Q9QXZ7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nr2e3Q9QXZ7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nr2e3Q9QXZ7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Nr2e3Q9QXZ7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nr2e3Q9QXZ7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nr2e3Q9QXZ7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nr2e3Q9QXZ7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nr2e3Q9QXZ7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nr2e3Q9QXZ7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nr2e3Q9QXZ7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nr2e3Q9QXZ7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nr2e3Q9QXZ7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nr2e3Q9QXZ7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nr2e3Q9QXZ7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nr2e3Q9QXZ7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Nr2e3Q9QXZ7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nr2e3Q9QXZ7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nr2e3Q9QXZ7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nr2e3Q9QXZ7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nr2e3Q9QXZ7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nr2e3Q9QXZ7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nr2e3Q9QXZ7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nr2e3Q9QXZ7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nr2e3Q9QXZ7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nr2e3Q9QXZ7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nr2e3Q9QXZ7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nr2e3Q9QXZ7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nr2e3Q9QXZ7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nr2e3Q9QXZ7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nr2e3Q9QXZ7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nr2e3Q9QXZ7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nr2e3Q9QXZ7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nr2e3Q9QXZ7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nr2e3Q9QXZ7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nr2e3Q9QXZ7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nr2e3Q9QXZ7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nr2e3Q9QXZ7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nr2e3Q9QXZ7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nr2e3Q9QXZ7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nr2e3Q9QXZ7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nr2e3Q9QXZ7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nr2e3Q9QXZ7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nr2e3Q9QXZ7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nr2e3Q9QXZ7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nr2e3Q9QXZ7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nr2e3Q9QXZ7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms