Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms