Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms