Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpc5Q9QX29 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms