Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX15

Clca3a1, Calcium-activated chloride channel regulator 3A-1, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a1Q9QX15 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms