Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms