Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms