Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms