Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sfmbt1Q9JMD1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms