Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdc42ep4Q9JM96 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdc42ep4Q9JM96 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdc42ep4Q9JM96 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdc42ep4Q9JM96 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdc42ep4Q9JM96 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdc42ep4Q9JM96 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdc42ep4Q9JM96 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdc42ep4Q9JM96 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdc42ep4Q9JM96 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdc42ep4Q9JM96 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdc42ep4Q9JM96 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdc42ep4Q9JM96 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdc42ep4Q9JM96 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdc42ep4Q9JM96 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdc42ep4Q9JM96 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdc42ep4Q9JM96 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdc42ep4Q9JM96 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdc42ep4Q9JM96 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdc42ep4Q9JM96 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdc42ep4Q9JM96 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdc42ep4Q9JM96 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdc42ep4Q9JM96 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdc42ep4Q9JM96 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdc42ep4Q9JM96 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdc42ep4Q9JM96 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdc42ep4Q9JM96 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdc42ep4Q9JM96 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdc42ep4Q9JM96 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdc42ep4Q9JM96 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdc42ep4Q9JM96 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdc42ep4Q9JM96 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdc42ep4Q9JM96 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdc42ep4Q9JM96 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdc42ep4Q9JM96 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdc42ep4Q9JM96 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdc42ep4Q9JM96 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdc42ep4Q9JM96 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdc42ep4Q9JM96 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdc42ep4Q9JM96 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdc42ep4Q9JM96 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdc42ep4Q9JM96 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdc42ep4Q9JM96 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdc42ep4Q9JM96 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdc42ep4Q9JM96 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdc42ep4Q9JM96 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdc42ep4Q9JM96 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdc42ep4Q9JM96 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdc42ep4Q9JM96 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdc42ep4Q9JM96 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdc42ep4Q9JM96 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdc42ep4Q9JM96 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdc42ep4Q9JM96 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdc42ep4Q9JM96 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms