Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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