Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV2

Trpc4ap, Short transient receptor potential channel 4-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4apQ9JLV2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms