Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL0

Crim1, Cysteine-rich motor neuron 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crim1Q9JLL0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Gm9440-201ENSMUST00000119667 539 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Gm16112-201ENSMUST00000159075 382 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Gm37751-201ENSMUST00000192440 1198 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 AC153512.2-201ENSMUST00000220363 1273 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Gm25131-201ENSMUST00000082653 151 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 CT010480.1-201ENSMUST00000223612 363 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 AC165260.5-201ENSMUST00000224640 1247 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 AC160962.2-201ENSMUST00000224761 632 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Gm13571-201ENSMUST00000124654 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Crim1Q9JLL0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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