Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms