Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL70

Fanca, Fanconi anemia group A protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancaQ9JL70 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FancaQ9JL70 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FancaQ9JL70 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FancaQ9JL70 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FancaQ9JL70 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FancaQ9JL70 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FancaQ9JL70 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FancaQ9JL70 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FancaQ9JL70 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FancaQ9JL70 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FancaQ9JL70 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FancaQ9JL70 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FancaQ9JL70 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FancaQ9JL70 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FancaQ9JL70 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FancaQ9JL70 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FancaQ9JL70 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FancaQ9JL70 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FancaQ9JL70 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FancaQ9JL70 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FancaQ9JL70 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FancaQ9JL70 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FancaQ9JL70 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FancaQ9JL70 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FancaQ9JL70 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FancaQ9JL70 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FancaQ9JL70 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FancaQ9JL70 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FancaQ9JL70 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FancaQ9JL70 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FancaQ9JL70 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FancaQ9JL70 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FancaQ9JL70 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FancaQ9JL70 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FancaQ9JL70 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FancaQ9JL70 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FancaQ9JL70 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FancaQ9JL70 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FancaQ9JL70 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FancaQ9JL70 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FancaQ9JL70 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FancaQ9JL70 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FancaQ9JL70 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FancaQ9JL70 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FancaQ9JL70 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FancaQ9JL70 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FancaQ9JL70 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
FancaQ9JL70 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FancaQ9JL70 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FancaQ9JL70 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FancaQ9JL70 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FancaQ9JL70 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FancaQ9JL70 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FancaQ9JL70 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FancaQ9JL70 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FancaQ9JL70 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FancaQ9JL70 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FancaQ9JL70 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FancaQ9JL70 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FancaQ9JL70 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FancaQ9JL70 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FancaQ9JL70 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FancaQ9JL70 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FancaQ9JL70 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FancaQ9JL70 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FancaQ9JL70 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FancaQ9JL70 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FancaQ9JL70 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FancaQ9JL70 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FancaQ9JL70 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FancaQ9JL70 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FancaQ9JL70 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
FancaQ9JL70 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FancaQ9JL70 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FancaQ9JL70 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FancaQ9JL70 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FancaQ9JL70 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FancaQ9JL70 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FancaQ9JL70 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FancaQ9JL70 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FancaQ9JL70 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FancaQ9JL70 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FancaQ9JL70 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FancaQ9JL70 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FancaQ9JL70 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FancaQ9JL70 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FancaQ9JL70 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FancaQ9JL70 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FancaQ9JL70 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FancaQ9JL70 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FancaQ9JL70 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FancaQ9JL70 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FancaQ9JL70 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FancaQ9JL70 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FancaQ9JL70 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FancaQ9JL70 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FancaQ9JL70 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FancaQ9JL70 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FancaQ9JL70 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FancaQ9JL70 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms