Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY5

Hip1r, Huntingtin-interacting protein 1-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hip1rQ9JKY5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hip1rQ9JKY5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hip1rQ9JKY5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hip1rQ9JKY5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Hip1rQ9JKY5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Hip1rQ9JKY5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hip1rQ9JKY5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms