Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms