Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms