Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Uchl3Q9JKB1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms