Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms