Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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