Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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