Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms