Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHW4

Eefsec, Selenocysteine-specific elongation factor, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EefsecQ9JHW4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
EefsecQ9JHW4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
EefsecQ9JHW4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EefsecQ9JHW4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
EefsecQ9JHW4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EefsecQ9JHW4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EefsecQ9JHW4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EefsecQ9JHW4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EefsecQ9JHW4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EefsecQ9JHW4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EefsecQ9JHW4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EefsecQ9JHW4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EefsecQ9JHW4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EefsecQ9JHW4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EefsecQ9JHW4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EefsecQ9JHW4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EefsecQ9JHW4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EefsecQ9JHW4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EefsecQ9JHW4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EefsecQ9JHW4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EefsecQ9JHW4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EefsecQ9JHW4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EefsecQ9JHW4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EefsecQ9JHW4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EefsecQ9JHW4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EefsecQ9JHW4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EefsecQ9JHW4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EefsecQ9JHW4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms