Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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