Protein–RNA interactions for Protein: Q9EST1

Gsdma, Gasdermin-A, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GsdmaQ9EST1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GsdmaQ9EST1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GsdmaQ9EST1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GsdmaQ9EST1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GsdmaQ9EST1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GsdmaQ9EST1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GsdmaQ9EST1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GsdmaQ9EST1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GsdmaQ9EST1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GsdmaQ9EST1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GsdmaQ9EST1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GsdmaQ9EST1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GsdmaQ9EST1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GsdmaQ9EST1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GsdmaQ9EST1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GsdmaQ9EST1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GsdmaQ9EST1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GsdmaQ9EST1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GsdmaQ9EST1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GsdmaQ9EST1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GsdmaQ9EST1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GsdmaQ9EST1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GsdmaQ9EST1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GsdmaQ9EST1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GsdmaQ9EST1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GsdmaQ9EST1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GsdmaQ9EST1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms