Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Trappc4Q9ES56 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trappc4Q9ES56 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trappc4Q9ES56 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trappc4Q9ES56 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trappc4Q9ES56 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trappc4Q9ES56 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc4Q9ES56 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc4Q9ES56 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc4Q9ES56 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc4Q9ES56 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc4Q9ES56 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc4Q9ES56 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc4Q9ES56 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc4Q9ES56 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc4Q9ES56 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc4Q9ES56 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc4Q9ES56 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc4Q9ES56 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc4Q9ES56 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc4Q9ES56 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms