Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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Ube3bQ9ES34 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube3bQ9ES34 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube3bQ9ES34 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube3bQ9ES34 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube3bQ9ES34 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube3bQ9ES34 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube3bQ9ES34 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube3bQ9ES34 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube3bQ9ES34 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube3bQ9ES34 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ube3bQ9ES34 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ube3bQ9ES34 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ube3bQ9ES34 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ube3bQ9ES34 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Ube3bQ9ES34 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ube3bQ9ES34 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Ube3bQ9ES34 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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Ube3bQ9ES34 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ube3bQ9ES34 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Ube3bQ9ES34 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Ube3bQ9ES34 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Ube3bQ9ES34 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ube3bQ9ES34 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ube3bQ9ES34 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ube3bQ9ES34 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ube3bQ9ES34 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ube3bQ9ES34 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ube3bQ9ES34 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ube3bQ9ES34 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ube3bQ9ES34 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ube3bQ9ES34 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ube3bQ9ES34 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ube3bQ9ES34 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ube3bQ9ES34 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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