Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms