Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms