Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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