Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Rhox9Q9EQM5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Rhox9Q9EQM5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhox9Q9EQM5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms