Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPW9

Tlr6, Toll-like receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr6Q9EPW9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlr6Q9EPW9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr6Q9EPW9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr6Q9EPW9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr6Q9EPW9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr6Q9EPW9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr6Q9EPW9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr6Q9EPW9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr6Q9EPW9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr6Q9EPW9 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr6Q9EPW9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr6Q9EPW9 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr6Q9EPW9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr6Q9EPW9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr6Q9EPW9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr6Q9EPW9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr6Q9EPW9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr6Q9EPW9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr6Q9EPW9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr6Q9EPW9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr6Q9EPW9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr6Q9EPW9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr6Q9EPW9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlr6Q9EPW9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlr6Q9EPW9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlr6Q9EPW9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlr6Q9EPW9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlr6Q9EPW9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlr6Q9EPW9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlr6Q9EPW9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlr6Q9EPW9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlr6Q9EPW9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlr6Q9EPW9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlr6Q9EPW9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlr6Q9EPW9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlr6Q9EPW9 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlr6Q9EPW9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlr6Q9EPW9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlr6Q9EPW9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tlr6Q9EPW9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tlr6Q9EPW9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tlr6Q9EPW9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tlr6Q9EPW9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tlr6Q9EPW9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tlr6Q9EPW9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr6Q9EPW9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr6Q9EPW9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr6Q9EPW9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr6Q9EPW9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr6Q9EPW9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr6Q9EPW9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr6Q9EPW9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr6Q9EPW9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr6Q9EPW9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr6Q9EPW9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr6Q9EPW9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr6Q9EPW9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr6Q9EPW9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr6Q9EPW9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr6Q9EPW9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr6Q9EPW9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr6Q9EPW9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr6Q9EPW9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr6Q9EPW9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr6Q9EPW9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr6Q9EPW9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr6Q9EPW9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr6Q9EPW9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr6Q9EPW9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr6Q9EPW9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tlr6Q9EPW9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tlr6Q9EPW9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tlr6Q9EPW9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tlr6Q9EPW9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tlr6Q9EPW9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tlr6Q9EPW9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tlr6Q9EPW9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tlr6Q9EPW9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tlr6Q9EPW9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tlr6Q9EPW9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tlr6Q9EPW9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tlr6Q9EPW9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tlr6Q9EPW9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tlr6Q9EPW9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tlr6Q9EPW9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tlr6Q9EPW9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlr6Q9EPW9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlr6Q9EPW9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlr6Q9EPW9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlr6Q9EPW9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlr6Q9EPW9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlr6Q9EPW9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlr6Q9EPW9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlr6Q9EPW9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlr6Q9EPW9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlr6Q9EPW9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlr6Q9EPW9 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlr6Q9EPW9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlr6Q9EPW9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlr6Q9EPW9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms