Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Xab2Q9DCD2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Xab2Q9DCD2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Xab2Q9DCD2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Xab2Q9DCD2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Xab2Q9DCD2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Xab2Q9DCD2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xab2Q9DCD2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xab2Q9DCD2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xab2Q9DCD2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xab2Q9DCD2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xab2Q9DCD2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xab2Q9DCD2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xab2Q9DCD2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xab2Q9DCD2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xab2Q9DCD2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xab2Q9DCD2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xab2Q9DCD2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xab2Q9DCD2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Xab2Q9DCD2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xab2Q9DCD2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xab2Q9DCD2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xab2Q9DCD2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xab2Q9DCD2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xab2Q9DCD2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xab2Q9DCD2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xab2Q9DCD2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xab2Q9DCD2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xab2Q9DCD2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xab2Q9DCD2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xab2Q9DCD2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xab2Q9DCD2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xab2Q9DCD2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xab2Q9DCD2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xab2Q9DCD2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xab2Q9DCD2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Xab2Q9DCD2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xab2Q9DCD2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Xab2Q9DCD2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xab2Q9DCD2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Xab2Q9DCD2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xab2Q9DCD2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xab2Q9DCD2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xab2Q9DCD2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms