Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAQ7

3110070M22Rik, RIKEN cDNA 3110070M22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110070M22RikQ9DAQ7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
3110070M22RikQ9DAQ7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
3110070M22RikQ9DAQ7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
3110070M22RikQ9DAQ7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
3110070M22RikQ9DAQ7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
3110070M22RikQ9DAQ7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
3110070M22RikQ9DAQ7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
3110070M22RikQ9DAQ7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
3110070M22RikQ9DAQ7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
3110070M22RikQ9DAQ7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
3110070M22RikQ9DAQ7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
3110070M22RikQ9DAQ7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
3110070M22RikQ9DAQ7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
3110070M22RikQ9DAQ7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
3110070M22RikQ9DAQ7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
3110070M22RikQ9DAQ7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
3110070M22RikQ9DAQ7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
3110070M22RikQ9DAQ7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
3110070M22RikQ9DAQ7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms