Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAG9

Phf7, PHD finger protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf7Q9DAG9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf7Q9DAG9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf7Q9DAG9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf7Q9DAG9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf7Q9DAG9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf7Q9DAG9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf7Q9DAG9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf7Q9DAG9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf7Q9DAG9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf7Q9DAG9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf7Q9DAG9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf7Q9DAG9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf7Q9DAG9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf7Q9DAG9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf7Q9DAG9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf7Q9DAG9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf7Q9DAG9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf7Q9DAG9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf7Q9DAG9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf7Q9DAG9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf7Q9DAG9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms