Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms