Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms