Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms