Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B7

Jam3, Junctional adhesion molecule C, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jam3Q9D8B7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms