Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms