Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms