Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc39Q9D5Y1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms