Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U0

Lpcat2b, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2B, mousemouse

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat2bQ9D5U0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lpcat2bQ9D5U0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lpcat2bQ9D5U0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lpcat2bQ9D5U0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lpcat2bQ9D5U0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lpcat2bQ9D5U0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lpcat2bQ9D5U0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lpcat2bQ9D5U0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lpcat2bQ9D5U0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lpcat2bQ9D5U0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lpcat2bQ9D5U0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lpcat2bQ9D5U0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lpcat2bQ9D5U0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Lpcat2bQ9D5U0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lpcat2bQ9D5U0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lpcat2bQ9D5U0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lpcat2bQ9D5U0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lpcat2bQ9D5U0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lpcat2bQ9D5U0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Lpcat2bQ9D5U0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lpcat2bQ9D5U0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lpcat2bQ9D5U0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lpcat2bQ9D5U0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Lpcat2bQ9D5U0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lpcat2bQ9D5U0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lpcat2bQ9D5U0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lpcat2bQ9D5U0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lpcat2bQ9D5U0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lpcat2bQ9D5U0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lpcat2bQ9D5U0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lpcat2bQ9D5U0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lpcat2bQ9D5U0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lpcat2bQ9D5U0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Lpcat2bQ9D5U0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lpcat2bQ9D5U0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lpcat2bQ9D5U0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lpcat2bQ9D5U0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lpcat2bQ9D5U0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lpcat2bQ9D5U0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Lpcat2bQ9D5U0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lpcat2bQ9D5U0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Lpcat2bQ9D5U0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Lpcat2bQ9D5U0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lpcat2bQ9D5U0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Lpcat2bQ9D5U0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Lpcat2bQ9D5U0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lpcat2bQ9D5U0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lpcat2bQ9D5U0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lpcat2bQ9D5U0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lpcat2bQ9D5U0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lpcat2bQ9D5U0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lpcat2bQ9D5U0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lpcat2bQ9D5U0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lpcat2bQ9D5U0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lpcat2bQ9D5U0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lpcat2bQ9D5U0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lpcat2bQ9D5U0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lpcat2bQ9D5U0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lpcat2bQ9D5U0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lpcat2bQ9D5U0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lpcat2bQ9D5U0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lpcat2bQ9D5U0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lpcat2bQ9D5U0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lpcat2bQ9D5U0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lpcat2bQ9D5U0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lpcat2bQ9D5U0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lpcat2bQ9D5U0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lpcat2bQ9D5U0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lpcat2bQ9D5U0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lpcat2bQ9D5U0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lpcat2bQ9D5U0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lpcat2bQ9D5U0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lpcat2bQ9D5U0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lpcat2bQ9D5U0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms