Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Zcchc13Q9D548 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Zcchc13Q9D548 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Zcchc13Q9D548 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Zcchc13Q9D548 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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