Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms