Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms